Biblioteka genomowa a biblioteka cDNA
Zawartość
- Treść: Różnica między biblioteką genomową a biblioteką cDNA
- Wykres porównania
- Co to jest Genomic Library?
- Co to jest biblioteka cDNA?
- Kluczowe różnice
Zarówno biblioteka genomowa, jak i biblioteka cDNA są wykorzystywane do klonowania genów w celu izolacji różnych DNA. Różnica między tymi dwiema bibliotekami polega na tym, że biblioteka genomowa zawiera fragmenty DNA, które wyrażają cały genom organizmu, podczas gdy w bibliotece cDNA mRNA jest pobierany z poszczególnych komórek organizmu, a następnie cDNA składa się z tego mRNA w katalizowanej reakcji przez enzym.
Treść: Różnica między biblioteką genomową a biblioteką cDNA
- Wykres porównania
- Co to jest Genomic Library?
- Co to jest biblioteka cDNA?
- Kluczowe różnice
Wykres porównania
Podstawa | Biblioteka genomowa | Biblioteka cDNA |
Definicja | Biblioteka genomowa to zbiór pełnego genomowego DNA z jednego organizmu. DNA jest przechowywane w populacji podobnych wektorów, z których każdy zawiera wyraźną wstawkę DNA. | Biblioteka cDNA to mieszanka sklonowanych fragmentów cDNA wstawionych do wybranych komórek gospodarza, które wspólnie tworzą pewną część transkryptomu organizmu. |
Wyrażenie | Cały genom | Tylko określone geny. |
Rozmiar | Większy | Mniejszy |
Introny | obecny | Nieobecny |
Wektor | Wykorzystuje plazmidy, kosmid, faga lambda, YAC i BAC do akomodacji dużych fragmentów. | Nie ma intronów, więc wykorzystuje plazmidy, fagemidy i fagi lambda, aby pomieścić skromne fragmenty. |
Co to jest Genomic Library?
Podczas procedury klonowania gen będący przedmiotem zainteresowania jest kopiowany z DNA oddzielonego od organizmu. Kiedy DNA zostaje oddzielone od organizmu, jego geny zostały wyekstrahowane jednocześnie. DNA organizmu składa się z tysięcy różnych genów. Inżynier genetyczny znajduje jeden konkretny gen, który koduje dane białko będące przedmiotem zainteresowania.
Nie ma absolutnie żadnej metody, dzięki której dany gen z DNA jest dostępny, więc naukowcy tworzą biblioteki genów do katalogowania DNA organizmu. Naukowcy wybierają pożądany gen z biblioteki. Biblioteka genów to grupa żywych kolonii bakteryjnych transformowanych unikalnymi fragmentami DNA w organizmie, które są źródłem pożądanego genu. DNA jest ekstrahowane z organizmu, aby zbudować bibliotekę, która jest zorganizowaną formą DNA. Biblioteka genomowa i cDNA to dwa rodzaje bibliotek genów. Liczne techniki klonowania genów zostały wykorzystane jako strategie genowe w technologii rekombinacji.
Fragmenty DNA są oddzielane przez cięcie specyficznymi enzymami restrykcyjnymi z macierzystego DNA. Te fragmenty są ligowane z cząsteczkami wektorowymi, a nagromadzone cząsteczki są przenoszone do komórek gospodarza, 1 cząsteczka w każdej komórce. Biblioteka genomowa składa się z intronów, śmieciowego DNA i szeregu innych fragmentów. W tej bibliotece DNA jest dzielone na mniejsze fragmenty w komórce. Następnie wszystkie małe części są wstawiane do wektora w celu utworzenia biblioteki. Biblioteka genomowa zawiera całe DNA całych genów, a komórka składa się ze wszystkich intronów. Genomowe DNA jest tłumaczeniem całego genomu. Nie koduje całej części na jednym kodonie ze względu na rozmiar intronów. W bibliotece genomowej nie ma żadnego mechanizmu składania, który powoduje trudności w ekspresji genów pobranych z tej biblioteki.
Co to jest biblioteka cDNA?
Biblioteka cDNA jest konstruowana poprzez wybranie jednej tkanki lub typu komórki. Następnie mRNA izoluje się z tej tkanki lub komórki. Kopia DNA cząsteczki mRNA składa się ze specyficznego enzymu enzymu odwrotnej transkryptazy. Więc biblioteka cDNA zawiera ten specyficzny DNA, który jest obecny w mRNA. W tej bibliotece nie znaleziono intronów ani sekwencji DNA. W tej bibliotece wszystkie klony są pełnej długości. Ponadto klon cDNA jest niezbędny do transfekcji komórek do produkcji białka lub do testów opartych na komórkach.
Kluczowe różnice
- Biblioteka genomowa została napisana bezpośrednio z genomowego DNA.
- Biblioteka cDNA została utworzona przy użyciu mRNA jako szablonu.
- Biblioteka genomowa zajmuje cały genom tego organizmu.
- Biblioteka cDNA reprezentuje tylko geny poszczególnych dolegliwości.
- Dwa enzymy, endonukleazy restrykcyjne i ligazy są ważne dla konstrukcji biblioteki genomowej.
- Enzym odwrotnej transkryptazy odgrywa znaczącą rolę w konstrukcji biblioteki cDNA.
- Biblioteka genomowa zajmuje DNA zarówno organizmów prokariotycznych, jak i eukariotycznych.
- Biblioteka cDNA reprezentuje DNA tylko organizmów eukariotycznych.
- Biblioteka cDNA jest zdolna do ekspresji genomu u bakterii prokariotycznych, ponieważ brakuje im intronów.
- Biblioteka genomowa nie jest w stanie powiedzieć w organizmie prokariotycznym, ponieważ ma introny, a organizm prokariotyczny nie ma żadnych maszyn do przetwarzania intronów.